В Смутное время, когда Новгород был занят шведами (1611–1617), башня утратила шатровую кровлю и зубчики. Восстановлена она была только через полвека, в 1657 году, затем ее еще несколько раз ремонтировали: в 1745, 1859 и в 1938–1939 годах. Во время Великой Отечественной войны сооружение сильно пострадало: снова была утрачена кровля, разрушены межэтажные перекрытия и верхняя часть кладки стен. Крупная реставрация была проведена в 1990–1995 годах, когда были восстановлены бойницы, боевые камеры, две внутренних лестницы, а также внутренняя и внешняя кладка здания. Но из-за отсутствия финансирования не все работы были завершены. Сейчас башня открыта для посещения.