После Октябрьской революции и закрытия Митрофановского монастыря Акатовская обитель стала центром православной жизни города. Верующие воронежцы приходили сюда послушать проповеди архиепископа Воронежского и Задонского Петра (Зверева), сосланного в 1929 году на Соловки и умершего там от тифа. В 1931 году закрыли и Акатовскую обитель, кладбище разорили, имущество растащили. После войны в бывшие монастырские кельи селили жителей разрушенного Воронежа. Со временем обитель опустела, стала разрушаться. Лишь в 1986 году началась реставрация колокольни. В 1989 году монастырь вернули Русской православной церкви. Теперь он стал женским, в стенах восстановленной святыни проживает более 50 сестер.
