Фигура первого воронежского епископа занимает особое место в истории города. Митрофан поддерживал строительство флота, активно жертвовал «на корабельное строение». С Петром I его связывали непростые отношения. Мемуаристы пересказывают такой анекдот: во время одного из приездов царя в Воронеж владыка отказался явиться к нему, ибо его апартаменты были украшены по западноевропейскому образцу статуями в античном вкусе. Разгневанный Петр угрожал Митрофану смертью за непослушание, но владыка твердо стоял на своем: «В жизни моей государь властен, но не прилично христианскому государю ставить языческих идолов и тем соблазнять простые сердца; и так охотнее он примет смерть, а не подтвердит присутствием своим сих языческих чтилищ». В итоге, «сколь ни был государь раздражен таковым грубым ответом и непослушанием архиерея сего, но любя и почитая в нем добродетели его», убрал статуи, а в каждый последующий свой визит в Воронеж обязательно заезжал и к Митрофану. После кончины святителя Петр сказал: «Не осталось у меня такого святого старца», — и лично понес гроб с телом усопшего.