По своему плану собор, посвященный Рождеству Иоанна Предтечи, очень похож на новгородский храм Успения на Торгу, заложенный по заказу князя Всеволода Мстиславича в 1135 году, вероятно, киевскими мастерами: в храме типа вписанного креста стена между притвором-нартексом и основным объемом превратилась в два восьмигранных столпа, значительно расширяя таким образом внутреннее пространство. Но уже через год после сооружения Успения на Торгу, в 1136 году, Всеволода Мстиславича окончательно изгнали из Новгорода. После нескольких лет странствий князь обосновался в Пскове, где вместе с ним могла оказаться и его артель зодчих. По крайней мере, по технике кладки стен из кирпича и плитняка и по размеру кирпича-плинфы Иоанновский собор похож на новгородскую церковь Иоанна Предтечи на Опоках (1127–1130). Объединяет псковский храм с новгородскими памятниками первой трети XII века и редкая композиция из трех куполов, появившаяся на соборах
Юрьева и
Антониева монастырей в Новгороде. Впрочем, в Пскове малые купола передвинуты с нартекса и башни на западные угловые ячейки. С храмом Антониева монастыря Иоанновский собор роднят также восьмигранные западные столпы.