Крепость расположена на краю Ижорской возвышенности и занимает высокий скалистый мыс. Вокруг основания скалы протекает река Копорка, которая в давние времена была полноводной. В XIII веке в этих краях находился один из погостов води — местного финно-угорского населения,
подчинявшегося Новгороду. В 1240 году вожан обложили данью ливонские рыцари, заложившие на этом мысу деревянную крепость. К этим событиям относится самое раннее упоминание о Копорье в Первой Новгородской летописи: «Тои же зимы придоша Немци на Водь с Чюдью, и повоеваша и дань на них возложиша, а город учиниша в Копорьи погосте». Однако спустя год новгородский князь Александр Ярославич, будущий Александр Невский, отвоевывает Копорье и сжигает ливонские укрепления.